El UNN IRUNTRAMU es la máxima autoridad del Gobierno Territorial Autónomo de la Nación Wampís. Se trata de la asamblea de 105 representantes o Irunin de las comunidades.
El Gobierno Ejecutivo Central es el órgano responsable del Gobierno y Administración del Gobierno Territorial Autónomo de la nación Wampís, con el Pamuk como jefe del Gobierno Territorial Autónomo de la Nación Wampís y el Pamuka ayatke como Vice – Presidente de Gobierno Autónomo.
Ambos, asamblea y gobierno central reciben la asesoría y recomendaciones del Consejo de Sabios de la Nación.
A nivel de cuenca se instituye el gobierno de cuenca cuya máxima autoridad es la asamblea de cuenca o Matsatkamu Iruntramu. Se instituye asimismo al Consejo de Sabios como un órgano ad hoc del Gobierno Territorial Autónomo de la Nación Wampís y está integrado/da por reconocidos y notables del pueblo caracterizados por su trayectoria, su fortaleza moral y visión como consejeros y consejeras. A nivel de comunidad la máxima autoridad es la asamblea comunal constituida por comuneros hábiles inscritos en Padrón de Comuneros con una Junta Directiva como órgano responsable del Gobierno y Administración de la Comunidad. Los artículos 50 al 72 del Estatuto detallan las competencias y funciones de estos órganos de gobierno; asimismo, define las competencias exclusivas, compartidas y concurrentes.